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搭建 Python 科学计算环境

最近在看《Python for Data Analysis》(利用 Python 进行数据分析)这本书,贴一点笔记,这一篇是关于环境搭建的。另外吐槽一下,书中还是有不少错误的,语法错误就发现了好多处,大概读完了之后会整理出一份勘误表出来,可能是因为写书的时候是 14 年,两年过去了,pandas 库也有了一些变化。

安装虚拟环境

不想把系统的 python 库搞得乱乱的(其实已经很乱了),所以还是建一个独立虚拟环境专门来做科学计算吧。具体的方法我在virtualenv 相关笔记这篇博客中已经详细写了,建议将启动虚拟环境的命令添加到终端的配置文件中去(使用 alias ),这样就避免每次一打开就输入一长串命令了。

因为科学计算社区的一些库还是基于 Python 2.x 版本的,所以这里我们使用的 Python 版本为 2.7。

然后使用以下命令一键安装所需要的库:

sudo pip install numpy pandas matplotlib jupyter scikit-learn

安装不上的请检查是不是需要翻墙。

IPython

熟悉 Python 的同学应该对这个解释器不陌生,自带的 Python 解释器实在是太弱了。它与传统的“edit-compile-run”(编辑-编译-运行)方式的区别在于,它鼓励使用“execute-explore”(执行-探索),所以特别适合用在计算和数据分析领域,可以方便得使用「试错法」和「迭代法」进行开发。这里主要介绍它基于 Web 的交互式笔记本功能(命令行中大同小异)。

开启 IPython Notebook

使用以下命令来打开 IPython Notebook:

(ENV2.7)$ jupyter notebook

这样 server 就启动了,浏览器会自动打开一个目录树。

Note:记住在启动了虚拟环境的状态下使用这条命令,要不然就会使用系统的 IPython 版本来运行。

然后我们新建一个 IPython Notebook 用作演示:

搭建 Python 科学计算环境

In [1] 中的命令是为了能让我们直接在 IPython Notebook 中集成显示 matplotlib 画的图片,所以如果是用作科学计算的话,首先先执行以下这条命令再说。

内省

在变量的前面或后面加上一个 ? 就可以将有关该对象的一些通用信息显示出来。

搭建 Python 科学计算环境

基本上什么都能看。

%run 命令

使用 %run 可以运行本地的 Python 脚本,并可以在 IPython 中访问脚本中定义的所有变量。

如果想要脚本能够访问 IPython 中的命名空间,可以使用 %run -i 命令。

测试代码的执行时间

使用 %time%timeit 可以用来测试代码的执行时间。

搭建 Python 科学计算环境

Example

下面使用一个具体的例子来演示 IPython Notebook 的使用。

使用到的数据可以在 Beyond the Top 1000 Names 下载到,这是一份包含1880-2015年每年出生婴儿姓名出现次数的数据表。

由于该数据按年份被分割成了好多文件,所以第一步我们需要把所有数据组装到一个 DataFrame 中去。

搭建 Python 科学计算环境

不知道这些 Python 代码没关系,因为这里只是用来演示 IPython Notebook。

然后我们按照性别和年度统计总出生数:

搭建 Python 科学计算环境

然后绘制出表格:

搭建 Python 科学计算环境

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